ツール:医用画像データベース
Cardiac Atlas Project
- http://www.cardiacatlas.org/
- Sunnybrook Cardiac Data : パブリックドメインの心臓MRIデータ
- MITEA : 3Dエコー左心室セグメンテーションのデータセット
- その他いくつかのデータセット
Virtual museum of congenital heart defects
ハンガリー
60年にわたり400例を超える先天性心疾患の標本コレクションとそのデジタル化
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6351808/
レビュー記事のみ.データの公開状況については不明.
DeepLesion
- https://www.nih.gov/news-events/news-releases/nih-clinical-center-releases-dataset-32000-ct-images
- 32,000以上のアノテーション済みCTデータセット
- Boxを通じてすぐにダウンロードできる.
The Cancer Image Archive (TCIA)
- https://www.cancerimagingarchive.net/
- DICOMデータセット
Virtual Population V2.0
- https://itis.swiss/virtual-population/virtual-population/vip2/
- おとなとこども計4例の人体STLデータセット
- 1体あたり約6,000円で購入可能(2017年)
Visible Human
- https://www.nlm.nih.gov/research/visible/visible_human.html
- 人体の詳細画像データセット.男女1名づつの検体をCT/MRI撮影およびスライスしてデータセットを作成.
- Male : MRIは4mm間隔で各スライスは256×256 pixel, 12bit.CTは1mm間隔で各スライスは512×512 pixel,12bit.スライス画像は1mm間隔で2048×1216 pixel, 24bit color
- Female : スライス画像は0.33mm間隔.他は Male と同じ.
- 最近フィルムを再スキャンして 4096 x 2700 pixel になったらしい.
- 入手方法:無償.上記ページの案内にそって,U.S. National Library of Medicine にデータ利用を申請する.
Visible Korean Human
- http://vkh3.kisti.re.kr/
- アジア人の人体詳細画像データセット.韓国における平均的な体格の男女1名づつの検体をCT/MRI撮影及びスライスしてデータセットを作成.
- 入手方法:問い合わせ中.
PadChest
- https://bimcv.cipf.es/bimcv-projects/padchest/
- 胸部X線画像のデータベース. 6.7万人からの16万枚の画像.アノテーション付き.
ISBI 2015 Challenge
- http://www-o.ntust.edu.tw/~cweiwang/ISBI2015/challenge1/
- Grand Challenges in Dental X-ray Image Analysis
Challenge #1: Automated Detection and Analysis for Diagnosis in Cephalometric X-ray Image
STACOM (Statistical Atlases and Computational Modelling of the Heart)
- http://stacom.cardiacatlas.org
- 2010年以降,いろんな challenge をやっている.一部はデータセットを入手可能.
MM-WHS: Multi-Modality Whole Heart Segmentation
- https://zmiclab.github.io/projects/mmwhs/
- provides 120 multi-modality cardiac images acquired in real clinical environment.
MIMIC
- https://mimic.physionet.org/
- ICU入院患者データ
- 日本語の解説記事:医療界のビッグデータ:MIMIC
Automated Cardiac Diagnosis Challenge (ACDC) dataset
- https://acdc.creatis.insa-lyon.fr
- Cine-MRI 150症例.5つのグループ:normal, myocardial infarction, dilated cardiomyopathy, hypertrophic cardiomyopathy, abnormal right ventricle.
Multi-sequence Cardiac MR Segmentation Challenge
- https://zmiclab.github.io/zxh/0/mscmrseg19/
- 45症例.心室の LGEMRI, T2, bSSFP データを組み合わせてセグメンテーションを行う.
SUN Colonoscopy Video Database
- http://amed8k.sundatabase.org
- 大腸内視鏡動画像のデータベース
HVSMR 2016 Challenge
- http://segchd.csail.mit.edu
- MICCAI Workshop on Whole-Heart and Great Vessel Segmentation from 3D Cardiovascular MRI in Congenital Heart Disease
- 2023年4月時点でデータ入手はできないが.将来的にデータ配布を再開する可能性があるとのこと.