ツール:医用画像データベース

資料:医用画像ツール

Cardiac Atlas Project

  • http://www.cardiacatlas.org/
  • Sunnybrook Cardiac Data : パブリックドメインの心臓MRIデータ
  • MITEA : 3Dエコー左心室セグメンテーションのデータセット
  • その他いくつかのデータセット

Virtual museum of congenital heart defects

ハンガリー
60年にわたり400例を超える先天性心疾患の標本コレクションとそのデジタル化
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6351808/
レビュー記事のみ.データの公開状況については不明.

DeepLesion

The Cancer Image Archive (TCIA)

Virtual Population V2.0

Visible Human

  • https://www.nlm.nih.gov/research/visible/visible_human.html
  • 人体の詳細画像データセット.男女1名づつの検体をCT/MRI撮影およびスライスしてデータセットを作成.
  • Male : MRIは4mm間隔で各スライスは256×256 pixel, 12bit.CTは1mm間隔で各スライスは512×512 pixel,12bit.スライス画像は1mm間隔で2048×1216 pixel, 24bit color
  • Female : スライス画像は0.33mm間隔.他は Male と同じ.
  • 最近フィルムを再スキャンして 4096 x 2700 pixel になったらしい.
  • 入手方法:無償.上記ページの案内にそって,U.S. National Library of Medicine にデータ利用を申請する.

Visible Korean Human

  • http://vkh3.kisti.re.kr/
  • アジア人の人体詳細画像データセット.韓国における平均的な体格の男女1名づつの検体をCT/MRI撮影及びスライスしてデータセットを作成.
  • 入手方法:問い合わせ中.

PadChest

ISBI 2015 Challenge

STACOM (Statistical Atlases and Computational Modelling of the Heart)

MM-WHS: Multi-Modality Whole Heart Segmentation

MIMIC

Automated Cardiac Diagnosis Challenge (ACDC) dataset

  • https://acdc.creatis.insa-lyon.fr
  • Cine-MRI 150症例.5つのグループ:normal, myocardial infarction, dilated cardiomyopathy, hypertrophic cardiomyopathy, abnormal right ventricle.

Multi-sequence Cardiac MR Segmentation Challenge

SUN Colonoscopy Video Database

HVSMR 2016 Challenge

  • http://segchd.csail.mit.edu
  • MICCAI Workshop on Whole-Heart and Great Vessel Segmentation from 3D Cardiovascular MRI in Congenital Heart Disease
  • 2023年4月時点でデータ入手はできないが.将来的にデータ配布を再開する可能性があるとのこと.

Combined Healthy Abdominal Organ Segmentation (CHAOS) Challenge from ISBI 2019

Beyond the Cranial Vault (BTCV) Challenge from MICCAI 2015

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