ツール：医用画像ビューワ・セグメンテーション

2023年10月30日資料：医用画像ツール

LiveVolume

• http://www.livevolume.com/
• 三次元画像, ボリュームデータ用3Dイメージビューワ．フリー

ImageJ / Fuji

• https://imagej.nih.gov/ij/
• 画像処理・画像解析ソフトウェア．フリー
• Fuji はその機能拡張版．http://imagej.net/Fiji

Osirix

• http://www.osirix-viewer.com/
• DICOM ビューワ．無償版と有償版あり → 有料化

Horos

• https://horosproject.org/
• Osiris から派生した DICOMビューワ・PACSシステム．Mac版のみ

YAKAMI DICOMツール集

• http://www.kuhp.kyoto-u.ac.jp/~diag_rad/intro/tech/dicom_tools.ja.html
• 研究用にDICOMファイルを扱うためのツール集．フリー

Stradwin

• http://mi.eng.cam.ac.uk/~rwp/stradwin/
• Polarisを使ってフリーハンドのエコー画像から3次元画像を得るツール．

Seg3D

• https://www.sci.utah.edu/cibc-software/seg3d.html
• ボリュームデータのセグメンテーションツール

CemrgApp

• https://cemrg.com/software/cemrgapp.html
• Motion Quantification, Anatomical Measurements, Scar Quantification, Morphological Measurements, Electrophysiology Simulations を対象にしている．
• Scar Quantification の手順，造影MRIから心房壁を抽出→LGEMRIに位置合わせ→ scar quantification については（異様に）ドキュメンテーションやビデオチュートリアルが充実している．

ITK-Snap

• http://www.itksnap.org/pmwiki/pmwiki.php
• ボリュームデータの編集ツール．昔から名前をよく聞くけど詳細未確認．

Medical Image Registration Toolkit (MIRTK)

• https://github.com/BioMedIA/MIRTK
• Marching Cubes アルゴリズムが使えるようだ．詳細未確認．

Meshlab

mmgtools

• https://github.com/MmgTools/mmg
• Surface and volume remeshers 詳細未確認

ParaView

• https://www.paraview.org

medInria

• https://med.inria.fr
• 2D/3D/4D image visualization, registration, diffusion MR processing and tractography.